Siden 2006 har Mols-linien mistet 600.000 passagerer om året. Årsagen til det markante fald er, ifølge Jyllands-Posten, at stadig flere vælger den faste forbindelse over Storebælt, og at finanskrisen har fået folk til at vælge færgeturen fra.
Nedturen har ikke kun ramt Mols-linien, også færgeafgange til Norge, Sverige og Tyskland er mindre populærer end tidligere.